Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4AP20338 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4AP20338 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4AP20338 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4AP20338 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4AP20338 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4AP20338 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4AP20338 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB4AP20338 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB4AP20338 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB4AP20338 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB4AP20338 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB4AP20338 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB4AP20338 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms