Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF3P17036 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms