Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms