Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms