Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2F2P13984 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms