Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFTRP13569 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFTRP13569 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFTRP13569 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFTRP13569 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFTRP13569 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFTRP13569 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CFTRP13569 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFTRP13569 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFTRP13569 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms