Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP3P12645 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BMP3P12645 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BMP3P12645 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BMP3P12645 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BMP3P12645 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms