Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCRP11274 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCRP11274 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCRP11274 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCRP11274 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCRP11274 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCRP11274 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCRP11274 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCRP11274 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCRP11274 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCRP11274 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCRP11274 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCRP11274 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms