Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms