Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD8BP10966 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CD8BP10966 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD8BP10966 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD8BP10966 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD8BP10966 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD8BP10966 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms