Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPD1P10809 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPD1P10809 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms