Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBSLP0DN79 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms