Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2AF1L5P0DN76 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms