Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM10L2BP0DMW5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms