Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms