Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA3P0C7M3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms