Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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