Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms