Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPBP07199 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPBP07199 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPBP07199 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPBP07199 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPBP07199 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPBP07199 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms