Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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HLA-DQB1P01920 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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