Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFNA2P01563 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFNA2P01563 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms