Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
F13A1P00488 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
F13A1P00488 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
F13A1P00488 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13A1P00488 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms