Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms