Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM37O94972 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM37O94972 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms