Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPM2O94759 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms