Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms