Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms