Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms