Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms