Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms