Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBNO60934 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBNO60934 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBNO60934 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBNO60934 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBNO60934 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBNO60934 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBNO60934 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBNO60934 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBNO60934 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms