Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNSO60931 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms