Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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