Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRC1O43663 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRC1O43663 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRC1O43663 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRC1O43663 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRC1O43663 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms