Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXA2O43364 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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HOXA2O43364 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA2O43364 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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HOXA2O43364 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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HOXA2O43364 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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HOXA2O43364 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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HOXA2O43364 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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HOXA2O43364 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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