Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms