Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCAO15360 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCAO15360 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms