Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGFO15240 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGFO15240 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGFO15240 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VGFO15240 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGFO15240 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VGFO15240 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGFO15240 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms