Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNPHO15079 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms