Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APAF1O14727 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APAF1O14727 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APAF1O14727 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APAF1O14727 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms