Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIBO00712 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIBO00712 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms