Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms