Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms