Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E9PBE3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E9PBE3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E9PBE3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E9PBE3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms