Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms