Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms