Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms