Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms