Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms