Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms